Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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