Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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