Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC10A1Q14973 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms