Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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