Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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