Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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