Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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