Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP1B1Q10567 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms