Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms