Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FMODQ06828 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms