Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms