Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms