Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms