Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms