Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HK3P52790 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HK3P52790 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HK3P52790 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms