Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms