Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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