Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms