Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX1P48742 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX1P48742 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX1P48742 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms