Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms