Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms