Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2E2P29084 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms