Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms