Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms