Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRHP20396 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRHP20396 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRHP20396 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRHP20396 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRHP20396 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRHP20396 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRHP20396 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRHP20396 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRHP20396 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms