Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DESP17661 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DESP17661 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DESP17661 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms