Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms