Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms