Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms