Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TO15178 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TO15178 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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