Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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