Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms