Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms