Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM247A6NEH6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms