Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms