Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms