Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms