Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms