Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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