Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1BQ9NZR2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms