Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOPCQ9HD26 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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