Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms