Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARD11Q9BXL7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARD11Q9BXL7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms