Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARAP1Q96P48 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms