Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

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Length 1,156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CD163Q86VB7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CD163Q86VB7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD163Q86VB7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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