Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD54Q6NXT1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms