Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms