Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A12Q504Y0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms