Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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