Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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ZFHX3Q15911 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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